El trabajo se encuentra estructurado en tres capítulos: En el primer capítulo se han desarrollado los siguientes ejes temáticos: Derecho y derecho consuetudinario de los pueblos indígenas en los instrumentos internacionales dentro del Convenio 169 de la OIT; la declaración de los derechos de los pueblos indígenas de las NN.UU. y otros instrumentos internacionales; las comunidades indígenas y campesinas en la Constitución Política del Estado abrogada de 1994; el desarrollo legal sobre la administración de justicia en las comunidades indígenas y campesinas en la normativa vigente en el país(Ley No. 1674, Ley No. 1970, Ley No. 1715, etc.); los antecedentes Jurisprudenciales sobre el sistema de justicia en las comunidades indígenas y campesinas sentados por el Tribunal Constitucional, asimismo se analiza las bases y características del nuevo modelo de Estado.
En el segundo capítulo, para sustentar el trabajo de investigación, se ha desarrollado un marco teórico y conceptual relacionados con las matrices civilizatorias occidental y andina, en cuyos contextos se definen y analizan los modelos de Estados, el monismo jurídico, el sistema jurídico indígena, las reformas constitucionales, el modelo de Estado Plurinacional e Intercultural y el pluralismo jurídico.
Finalmente, en el tercer capítulo se ha desarrollado el enfoque metodológico y los resultados obtenidos en el trabajo de investigación, estableciéndose la metodología aplicada con relación a los ámbitos de investigación: el sistema de justicia en la comunidad Ñuñu Mayani y la jurisdicción agroambiental. Se concluye el trabajo analizando los límites que imponen tanto la Constitución como la Ley de Deslinde Jurisdiccional.