El IIRSA pone énfasis en las conexiones viales transoceánicas y en el paso hacia los puertos del Pacífico, bajo la lógica fundamental de abaratar los costos de transporte, principalmente de la soya, e incentivar una mayor producción de este "commodity", con alta y creciente demanda de mercado, proceso además acicateado por la lógica de los agrobiocombustibles. Este enfoque se proyecta en gran medida con un importante apoyo financiero de bancos y agencias internacionales y en especial por el interés del Brasil que llega a liderar, muchas acciones.

El problema del IIRSA radica en su extrema polarización hacia una visión economicista, situación de todo compatible con las políticas de los gobiernos de los países que participan, quienes han marginado la gestión ambiental y, por tanto los recaudos ambientales y sociales pertinentes.